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數(shù)據(jù)挖掘下的醫(yī)學(xué)生科研能力培養(yǎng)模式

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數(shù)據(jù)挖掘下的醫(yī)學(xué)生科研能力培養(yǎng)模式

[摘要]要適應(yīng)現(xiàn)代醫(yī)療的新形式,醫(yī)學(xué)生必須具備良好的科學(xué)素養(yǎng)和科研能力,而傳統(tǒng)的教學(xué)模式很難適應(yīng)這一需求。作者建立了基于數(shù)據(jù)挖掘醫(yī)學(xué)生科研能力培養(yǎng)模式,使學(xué)生全程參與課題的整個(gè)過(guò)程,通過(guò)整合運(yùn)用數(shù)據(jù)庫(kù)培養(yǎng)醫(yī)學(xué)生課題設(shè)計(jì)的能力、文獻(xiàn)檢索培養(yǎng)醫(yī)學(xué)生解決問(wèn)題的能力、數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)培養(yǎng)醫(yī)學(xué)生綜合分析的能力,以及論文撰寫(xiě)培養(yǎng)醫(yī)學(xué)生的邏輯思維能力,摸索出一種讓更多醫(yī)學(xué)生掌握數(shù)據(jù)挖掘技術(shù),成為既具有創(chuàng)新能力又具備科研素養(yǎng)的綜合性醫(yī)學(xué)人才的創(chuàng)新培養(yǎng)模式。

[關(guān)鍵詞]科研能力;數(shù)據(jù)挖掘;醫(yī)學(xué)生;醫(yī)學(xué),教育;培養(yǎng)模式;教學(xué)方法

現(xiàn)代社會(huì)科學(xué)技術(shù)日新月異,對(duì)當(dāng)代醫(yī)學(xué)生的綜合素質(zhì)提出了更高的要求,要適應(yīng)現(xiàn)代醫(yī)療的新形式,醫(yī)學(xué)生必須具備良好的科學(xué)素養(yǎng)和科研能力。《教育部關(guān)于全面提高高等教育質(zhì)量的若干意見(jiàn)》中指出:支持本科生參與科研活動(dòng),早進(jìn)課題、早進(jìn)實(shí)驗(yàn)室、早進(jìn)團(tuán)隊(duì)[1]。目前,我國(guó)的醫(yī)學(xué)本科教育主要是以理論知識(shí)學(xué)習(xí)和臨床實(shí)習(xí)為主,但是缺乏對(duì)學(xué)生科研能力的培養(yǎng)[2-3]。此外,在醫(yī)學(xué)生參與的科研項(xiàng)目中,又通常是以調(diào)查研究為主,而參與實(shí)驗(yàn)的科研項(xiàng)目又往往是按照指導(dǎo)教師設(shè)計(jì)的課題進(jìn)行機(jī)械操作,缺乏自主創(chuàng)新性,對(duì)培養(yǎng)醫(yī)學(xué)生自身的科研能力幫助不大。數(shù)據(jù)挖掘是指從大量的、不完整的、模糊的各種數(shù)據(jù)中提取隱藏的、不被人發(fā)現(xiàn)的,但又存在有價(jià)值信息的探索過(guò)程[4]。基于數(shù)據(jù)挖掘的醫(yī)學(xué)生科研能力培養(yǎng)模式是用數(shù)據(jù)挖掘指導(dǎo)課題設(shè)計(jì)和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證等方面全面培養(yǎng)學(xué)生的科研思維和技能的模式,激發(fā)學(xué)生的積極性、主動(dòng)性和創(chuàng)造性,使醫(yī)學(xué)生能在實(shí)踐中更好地理解生物化學(xué)與分子生物學(xué)、病理學(xué)、醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)、病理生理學(xué)、診斷學(xué)、生物信息學(xué)等課程的內(nèi)容,并且培養(yǎng)了良好的科研習(xí)慣和科研思路[5-6]。本文主要闡述了基于數(shù)據(jù)挖掘的醫(yī)學(xué)生科研能力培養(yǎng)模式構(gòu)建方案,主要內(nèi)容如下。

1整合運(yùn)用數(shù)據(jù)庫(kù)培養(yǎng)醫(yī)學(xué)生課題設(shè)計(jì)的能力

以往常規(guī)的教學(xué)中,均是由教師提出一個(gè)科研課題,然后學(xué)生按照教師的課題設(shè)計(jì)開(kāi)展相應(yīng)的科學(xué)研究,在這個(gè)過(guò)程中,學(xué)生僅僅是一個(gè)執(zhí)行者,單純的實(shí)驗(yàn)操作員,沒(méi)有自己的科研思路[7]。但是如果讓一個(gè)剛接觸科研時(shí)間不長(zhǎng),沒(méi)有任何經(jīng)驗(yàn)的學(xué)生自己設(shè)計(jì)出一個(gè)課題,不僅對(duì)學(xué)生的要求極高,而且學(xué)生自己設(shè)計(jì)課題方案的合理性及可行性也存疑。在基于數(shù)據(jù)挖掘的醫(yī)學(xué)生科研能力培養(yǎng)模式下,每個(gè)學(xué)生先確定自己感興趣的,準(zhǔn)備下一步研究的疾病類型;然后組織學(xué)生學(xué)習(xí)GEO、Oncomine和TC-GA數(shù)據(jù)庫(kù)的使用;從這些數(shù)據(jù)庫(kù)中根據(jù)各自選擇研究的疾病,篩選出疾病和非疾病組之間的差異表達(dá)基因,進(jìn)而設(shè)計(jì)出自己的課題研究方案。由于疾病類型是學(xué)生自己選擇的,充分調(diào)動(dòng)了學(xué)生的學(xué)習(xí)積極性,激發(fā)了學(xué)習(xí)興趣,讓學(xué)生從傳統(tǒng)的“教師讓我學(xué)習(xí)”轉(zhuǎn)變成了“學(xué)生的自主學(xué)習(xí)”,在培養(yǎng)學(xué)生的自主學(xué)習(xí)能力上起到了很好的促進(jìn)作用,也有利于培養(yǎng)學(xué)生的學(xué)術(shù)創(chuàng)新能力[8-9]。在學(xué)習(xí)相應(yīng)數(shù)據(jù)庫(kù)使用時(shí),擴(kuò)展了學(xué)生的科研技能,以往的教學(xué)只重視教科書(shū)上的知識(shí),但對(duì)于醫(yī)學(xué)生來(lái)說(shuō)課本上的知識(shí)遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠,隨著醫(yī)學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,目前醫(yī)學(xué)已經(jīng)成為一門(mén)涉及人工智能、生物領(lǐng)域、數(shù)據(jù)挖掘、計(jì)算機(jī)編程等的綜合學(xué)科[10]。通過(guò)本培養(yǎng)模式,學(xué)生可迅速掌握醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的使用,具備基本的生物信息分析技能,有利于提高自身競(jìng)爭(zhēng)力,更好地適應(yīng)未來(lái)的工作崗位。此外,課題方案是學(xué)生在整合多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)基礎(chǔ)上設(shè)計(jì)出來(lái)的,課題的可行性得到了很大程度的保證,有利于后續(xù)科研工作的順利進(jìn)行。

2文獻(xiàn)檢索培養(yǎng)醫(yī)學(xué)生解決問(wèn)題的能力

在科學(xué)研究的過(guò)程中遇到問(wèn)題,碰到困難是顯而易見(jiàn)的,但是學(xué)生如何解決遇到的問(wèn)題與困難呢?通常情況下學(xué)生都是咨詢課題指導(dǎo)教師,或者是詢問(wèn)高年級(jí)的學(xué)長(zhǎng)學(xué)姐,由他們對(duì)各種問(wèn)題進(jìn)行一一解答。這的確是一個(gè)有效的解決方式,但是如果每次有問(wèn)題都是這樣解決,學(xué)生本人在這個(gè)過(guò)程中并沒(méi)有培養(yǎng)自身解決問(wèn)題的能力,而且對(duì)出現(xiàn)的問(wèn)題沒(méi)有進(jìn)行深入地分析,也沒(méi)有進(jìn)行相應(yīng)地嘗試,僅僅是一味地接受別人的解決方案,不利于學(xué)生今后獨(dú)立開(kāi)展科研工作[11]。在基于數(shù)據(jù)挖掘的醫(yī)學(xué)生科研能力培養(yǎng)模式下,學(xué)生從數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出了一些差異表達(dá)基因,但是這些基因中很多都是別人已經(jīng)研究過(guò)的,這些已經(jīng)研究的基因不必納入下一步的研究,因此現(xiàn)在要解決的問(wèn)題就是如何從這些基因中選出還沒(méi)有被研究過(guò)的“新”基因進(jìn)行課題設(shè)計(jì)。這時(shí)候指導(dǎo)學(xué)生進(jìn)行文獻(xiàn)檢索,根據(jù)檢索出的文獻(xiàn)進(jìn)行綜合分析,自己找出目前還沒(méi)有被研究的基因進(jìn)行下一步的研究,培養(yǎng)了學(xué)生自己解決問(wèn)題的能力。文獻(xiàn)檢索能力對(duì)于醫(yī)學(xué)生來(lái)說(shuō)尤為重要,最新、最可靠的醫(yī)學(xué)研究成果都是發(fā)表在相應(yīng)的期刊上,而如何將這些成果檢索出來(lái),這是很多醫(yī)學(xué)生都欠缺的能力。對(duì)于學(xué)習(xí)社會(huì)科學(xué)的學(xué)生而言,會(huì)使用中國(guó)知網(wǎng)檢索中文論文可能就夠用了,但是對(duì)于醫(yī)學(xué)生來(lái)說(shuō),國(guó)外出版的權(quán)威期刊較多,如何檢索英文論文,從中學(xué)習(xí)最新的醫(yī)學(xué)知識(shí),并不是給一個(gè)檢索網(wǎng)址就可以實(shí)現(xiàn)的。本培養(yǎng)模式讓學(xué)生首先學(xué)會(huì)了從PubMed文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索所需文獻(xiàn)的基本流程,然后自己動(dòng)手搜索文獻(xiàn),并且從文獻(xiàn)中篩選出符合自身需求的文獻(xiàn)進(jìn)行精讀,切實(shí)提高了學(xué)生的實(shí)際運(yùn)用能力和英文閱讀能力,也擴(kuò)展了學(xué)生的醫(yī)學(xué)知識(shí),有利于培養(yǎng)醫(yī)學(xué)生的科研思維,提升科研素質(zhì)。

3數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)培養(yǎng)醫(yī)學(xué)生綜合分析的能力

在科研過(guò)程中會(huì)得到各種各樣的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)是支持課題理論的強(qiáng)力支撐,如果數(shù)據(jù)不會(huì)分析,甚至分析錯(cuò)誤,整個(gè)實(shí)驗(yàn)就白費(fèi)了,課題也不能完成,所以數(shù)據(jù)分析能力的培養(yǎng)在科研中至關(guān)重要。數(shù)據(jù)分析中最常用到的就是統(tǒng)計(jì)分析,分析實(shí)驗(yàn)組的數(shù)據(jù)相對(duì)于對(duì)照組是否有顯著性。通常學(xué)生需要經(jīng)過(guò)大量長(zhǎng)時(shí)間的實(shí)驗(yàn)操作,才能得到少量的幾組實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),整個(gè)過(guò)程時(shí)間跨度大,而且很多時(shí)候花費(fèi)了大量人力、物力得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果并不理想,或者實(shí)驗(yàn)不成功,根本沒(méi)有數(shù)據(jù),而一個(gè)課題周期的研究時(shí)間有限,這就造成了很多學(xué)生還沒(méi)有到數(shù)據(jù)分析這一步就止步了,根本沒(méi)有得到相應(yīng)的鍛煉。在基于數(shù)據(jù)挖掘的醫(yī)學(xué)生科研能力培養(yǎng)模式下,指導(dǎo)學(xué)生從數(shù)據(jù)庫(kù)中下載相應(yīng)的臨床病理資料,可以獲取到大量的臨床病例特征數(shù)據(jù),同時(shí)這樣的數(shù)據(jù)真實(shí)可靠,學(xué)生進(jìn)一步將之前選擇的目前還無(wú)人研究的基因與臨床病例特征數(shù)據(jù)進(jìn)行相關(guān)性分析,即熟悉了統(tǒng)計(jì)軟件SPSS的使用,也提升了學(xué)生的醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)分析水平。數(shù)據(jù)分析統(tǒng)計(jì)能力是醫(yī)學(xué)生需重點(diǎn)培養(yǎng)的基本能力之一,但是由于抽象的數(shù)學(xué)理論及復(fù)雜多變的醫(yī)學(xué)實(shí)際問(wèn)題,醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)課程一直無(wú)法取得好的教學(xué)效果,很多醫(yī)學(xué)生學(xué)完此課程后,遇到實(shí)際問(wèn)題完全不會(huì)處理。本培養(yǎng)模式讓學(xué)生處理自己下載的基因表達(dá)譜和臨床病理資料,在實(shí)踐中運(yùn)用和鞏固課本學(xué)到的知識(shí),同學(xué)之間互相交流,互相審核,將傳統(tǒng)教學(xué)中枯燥的數(shù)字運(yùn)算轉(zhuǎn)變?yōu)榉e極、主動(dòng)、高效的學(xué)習(xí)方式,有利于培養(yǎng)醫(yī)學(xué)生在科學(xué)研究中綜合分析的能力。

4論文撰寫(xiě)培養(yǎng)醫(yī)學(xué)生的邏輯思維能力

科研論文的撰寫(xiě)是科研能力培養(yǎng)必不可少的部分,論文是呈現(xiàn)科研成果最直接有效的方式,以往的論文寫(xiě)作課程大都是展示一些已出版的論文,讓學(xué)生學(xué)習(xí)論文寫(xiě)作的規(guī)范格式,但是學(xué)生沒(méi)有參與感,只是紙上談兵[12]。如果讓學(xué)生參與課題研究的整個(gè)過(guò)程后再撰寫(xiě)論文是很好的方式,但是一個(gè)完整課題的實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程已經(jīng)占據(jù)了絕大部分時(shí)間,留給學(xué)生撰寫(xiě)論文的時(shí)間有限,并且課題通常是指導(dǎo)教師設(shè)計(jì)的,遇到問(wèn)題是教師解決的,有時(shí)候數(shù)據(jù)分析也是教師完成的,由此學(xué)生對(duì)整個(gè)課題的理解不深,很難完成高質(zhì)量的論文。在基于數(shù)據(jù)挖掘的醫(yī)學(xué)生科研能力培養(yǎng)模式下,學(xué)生的課題是自己設(shè)計(jì)的,實(shí)施到完成都是學(xué)生全程參與的,科研過(guò)程中遇到問(wèn)題是學(xué)生自己通過(guò)文獻(xiàn)檢索解決,同時(shí)數(shù)據(jù)也是學(xué)生從數(shù)據(jù)庫(kù)中下載并進(jìn)行分析統(tǒng)計(jì),在這樣的情形下撰寫(xiě)論文,學(xué)生得到了最大限度的鍛煉,對(duì)整個(gè)課題的理解也特別深入,有利于提升邏輯思維能力,培養(yǎng)學(xué)生思維的嚴(yán)謹(jǐn)性。

5小結(jié)

總之,建立全新的醫(yī)學(xué)生科研能力培養(yǎng)模式,使學(xué)生全程參與課題的整個(gè)過(guò)程,學(xué)會(huì)整合運(yùn)用數(shù)據(jù)庫(kù)、文獻(xiàn)檢索、數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)及撰寫(xiě)論文,可提升學(xué)生的課題設(shè)計(jì)能力、解決問(wèn)題能力、綜合分析能力和邏輯思維能力,同時(shí)也讓更多的醫(yī)學(xué)生掌握數(shù)據(jù)挖掘技術(shù),成為既具有創(chuàng)新能力又具備科研素養(yǎng)的綜合性醫(yī)學(xué)人才。

作者:莫之婧 陳穎 單位:桂林醫(yī)學(xué)院生物技術(shù)學(xué)院

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